Service d'édition génétique de

Cænorhabditis elegans

SEGiCel
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2026-05-05 - Offre de poste en mobilité — CNRS NOEMI

Le CNRS a attribué à notre plateforme un poste en NOEMI au niveau ingénieur d’étude. Cette mobilité est ouverte à tous les agents du service public (fonctionnaires et CDI).

Merci de contacter Thomas Boulin pour plus de renseignements.

La campagne de recrutement est actuellement ouverte et se clôturera le 2 juin 2026.

 Voir l’offre sur emploi.cnrs.fr

Une expérience avec C. elegans serait un atout apprécié, bien que non indispensable.
En revanche, une solide maîtrise des techniques de biologie moléculaire et/ou en génie génétique (CRISPR) constitueraient un réel avantage pour une intégration rapide et efficace au sein de la plateforme.

La plateforme

Présentation & Mission

SEGiCel est une plateforme de service dédiée à la communauté scientifique française, spécialisée dans l'édition du génome du nématode modèle Caenorhabditis elegans.

Grâce aux technologies CRISPR/Cas9, SEGiCel réalise des modifications ciblées : mutations ponctuelles, délétions de gènes ou insertion de séquences codantes (ex. protéines fluorescentes).

>600
Lignées produites
17
Équipes partenaires
10
Ans d'expertise
  Afin de reconnaître l'activité de SEGiCel, merci d'inclure la mention suivante dans vos publications:
"Some strains were generated by SEGiCel (SFR Santé Lyon Est CNRS UAR 3453, Lyon, France) with the support of CNRS, Lyon 1 Université Claude Bernard, and IBiSA, within the framework of Celphedia."
CNRS
Lyon 1 University
SFR Santé

Historique

Après 10 ans comme UMS 3421 du CNRS, SEGiCel a rejoint la SFR Santé Lyon-Est de Lyon 1 Université Claude Bernard en janvier 2021, tout en continuant de bénéficier du soutien du CNRS. Installée à la faculté de médecine Rockefeller, la plateforme travaille en proximité directe avec le laboratoire MeLiS.

Objectifs

SEGiCel mutualise un savoir-faire national en ingénierie du génome de C. elegans, au service de la recherche fondamentale et clinique. Elle conseille et accompagne les équipes dans leurs projets d'édition génomique.

Labellisations

2024

En novembre 2024, SEGiCel a reçu pour la première fois le label IBiSA. Le GIS IBiSA coordonne la politique nationale de labellisation et de soutien aux infrastructures nationales de recherche en biologie et santé (INBS). SEGiCel rejoint ainsi ce réseau de plus de 200 plateformes nationales.


2024

En avril 2024, SEGiCel a intégré l’infrastructure de recherche (IR) Celphedia. Sa mission est de soutenir la communauté scientifique universitaire et industrielle afin d’accélérer les découvertes en biologie et d’améliorer la recherche biomédicale. Celphedia offre un accès à de nombreux organismes modèles pour répondre aux enjeux de la biologie moderne et aux défis sociétaux. Cet accès favorise le développement d’approches multi-modèles, de la création au phénotypage et à l’archivage. L’objectif est de développer et pérenniser des méthodologies innovantes et standardisées au service de la communauté scientifique.

L'équipe

Personnels de SEGiCel

Margaux GIBERT

Margaux GIBERT

Ingénieure d'étude · IE CNRS
margaux.gibert@univ-lyon1.fr
04 26 68 82 84
Marielle LIMOGES

Marielle LIMOGES

Ingénieure d'étude · CDD
marielle.limoges@univ-lyon1.fr
04 26 68 82 84
Thomas BOULIN

Thomas BOULIN

Directeur · DR2 CNRS
thomas.boulin@univ-lyon1.fr
04 26 68 82 82

Organisme modèle

Le nématode Caenorhabditis elegans

C. elegans

Le nématode C. elegans est un organisme modèle génétique utilisé par une grande communauté internationale pour aborder un large éventail de questions biologiques et physiopathologiques.

Grâce aux technologies CRISPR/Cas9, il est aujourd'hui possible de générer rapidement et à faible coût tout type de modification génomique : mutations ponctuelles, délétions, insertions de séquences codantes (protéines fluorescentes), ou remplacement de séquences.

Comment ça marche

Méthode de travail

Clients SEGiCel

1. Demande initiale

Adressez votre demande à segicel@univ-lyon1.fr en décrivant brièvement vos besoins. Si SEGiCel peut prendre en charge votre projet, nous définirons ensemble objectifs, faisabilité et délais par visio-conférence.

2. Stratégie & réalisation

Une fois la demande acceptée, nous préparons la stratégie détaillée en coordination avec vous, en tenant compte de la littérature et des contraintes expérimentales spécifiques.

3. Validation & livraison

Toutes les lignées sont validées par séquençage Sanger et accompagnées d'un rapport détaillé. SEGiCel assure également le stockage cryogénique de l'ensemble des lignées produites.

Collection

Ressources génétiques

Protéines fluorescentes

Nous disposons d'une large collection de séquences codant des protéines fluorescentes adaptées à C. elegans.

Il est également possible de nous faire parvenir des séquences spécifiques pour votre projet. Nous pouvons vous conseiller sur le choix de rapporteurs en fonction des équipements d'imagerie à votre disposition.

Rejoindre SEGiCel

Offres de Stage

Offres de stage

Tout au long de l'année, SEGiCel accueille des stagiaires à tous niveaux, intéressés par une expérience professionnelle sur une plateforme de biotechnologie de service.

Vous apprendrez à manipuler C. elegans et les dernières techniques de biologie moléculaire.

Candidature (parcours, CV, lettre de motivation) à envoyer à Thomas BOULIN par e-mail.

Stagiaires SEGiCel

Théodore PELLETIER RIMBERT — 2e année BTS Biotechnologies, Lycée La Martinière Duchère Lyon 9e. Stage janv.–mars 2021.
Lisa ROLLET — 1ère année BTS Biotechnologies, Lycée La Martinière Duchère Lyon 9e. Stage mai–juil. 2021.

Recherche

Publications de nos utilisateurs

  Afin de reconnaître l'activité de SEGiCel, merci d'inclure la mention suivante dans vos preprint et publications:
"Some strains were generated by SEGiCel (SFR Santé Lyon Est CNRS UAR 3453, Lyon, France) with the support of CNRS, Lyon 1 Université Claude Bernard, and IBiSA, within the framework of Celphedia."

2026

Blancfuney C et al. Critical role of P-Glycoprotein-9 in ivermectin tolerance in nematodes. PLoS Pathog. 2026 Mar 23;22(3):e1013355. PMID: 41871095.
Mialon M et al. A trans-synaptic IgLON adhesion molecular complex directly contacts and clusters a nicotinic receptor. Nature Communications. 2026 Jan 22;17(1):1404. PMID: 41571644
Dieng J et al. Partial coupling of proliferation and differentiation programs during Caenorhabditis elegans intestine development. Development 2026 Jan 15;153(2):dev205144. PMID: 41472615

2025

Cizeron M et al. The nonfibrillar multiplexin collagen CLE-1 defines cholinergic synapse identity. Science Advances 2025 Nov 21;11(47):eadz1291. PMID: 41259523
Sechi S, Galaup C, Jospin M, Boulin T. Functional validation of human SK channels variants causing NEDMAB and Zimmermann-Laband syndrome-3 in C. elegans. Brain Communications 2025;7(5):fcaf351. PMID: 41040851
Roumbo L et al. The MAST kinase KIN-4 carries out mitotic entry functions of Greatwall in C. elegans. EMBO Journal 2025 Apr;44(7):1943-1974. PMID: 39962268
Sonntag T et al. A defining member of the new cysteine-cradle family is an aECM protein signalling skin damage in C. elegans. PLoS Genet. 2025 Mar 20;21(3):e1011593. PMID: 40112269
Aguilar GR et al. Functional analysis of conserved C. elegans bHLH family members uncovers lifespan control by a peptidergic hub neuron. PLoS Biology 2025 Jan 6;23(1):e3002979. PMID: 39761329
Mehraj A et al. A polymorphic inframe deletion in the ODR-10 extracellular loop 2 abolishes diacetyl sensing. MicroPubl Biol. 2025. PMID: 40852036

2024

Andrini O, Ben Soussia I, … Jospin M, Boulin T. Constitutive sodium permeability in a C. elegans two-pore domain potassium channel. PNAS. 2024 Oct 22;121(43):e2400650121. PMID: 39405352
Mignerot L et al. Natural variation in the Caenorhabditis elegans egg-laying circuit modulates an intergenerational fitness trade-off. Elife. 2024 Apr 2;12:RP88253. PMID: 38564369
Correa E et al. UNC-30/PITX coordinates neurotransmitter identity with postsynaptic GABA receptor clustering. Development. 2024 Aug 15;151(16):dev202733. PMID: 39190555
Peysson A, Zariohi N, Gendrel M, … Andrini O, Boulin T. Wnt-Ror-Dvl signalling and the dystrophin complex organize planar-polarized membrane compartments in C. elegans muscles. Nat Commun. 2024 Jun 10;15(1):4935.
Demouchy F et al. PAR-4/LKB1 prevents intestinal hyperplasia by restricting endoderm specification in Caenorhabditis elegans embryos. Development. 2024;151(1):dev202205. PMID: 38078543
González R, Félix MA. Naturally-associated bacteria modulate Orsay virus infection of Caenorhabditis elegans. PLoS Pathog. 2024 Jan 17;20(1):e1011947.

2023

Florin F et al. Calcineurin-Dependent Homeostatic Response of C. elegans Muscle Cells upon Prolonged Activation of Acetylcholine Receptors. Cells. 2023 Sep 3;12(17):2201.

2021

Bidaud-Meynard A et al. High resolution dynamic mapping of the C. elegans intestinal brush border. Development. 2021 Oct 27:dev200029.

2019

Bidaud-Meynard A et al. A V0-ATPase-dependent apical trafficking pathway maintains the polarity of the intestinal absorptive membrane. Development. 2019;146(11):dev174508.

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Contacts & Accès

SEGiCel — SFR Santé Lyon-Est (CNRS UMS3453 - INSERM US7)
Lyon 1 Université Claude Bernard
3ème étage, aile D
8 avenue Rockefeller
69373 Lyon Cedex 08